Заседание семинара "Междисциплинарный научный семинар по биоинформатике и системной компьютерной биологии" 04.03.2020 в 11-00. "Циркадные ритмы молекулярно-биологических процессов млекопитающих: анализ данных и математическое моделирование", Подколодный Николай Леонтьевич

В каждой клетке организма млекопитающих работает автономный эндогенный молекулярно-генетический механизм циркадных часов с периодом близким к 24 часам, который синхронизирует суточную ритмику разнообразных клеточных функций и биологических процессов. Нарушение суточных ритмов может привести к развитию серьёзных патологий, включая рак, сердечно-сосудистые, нейродегенеративные, воспалительные заболевания и др.

В докладе будут представлены методы и результаты анализа данных по экспрессии генов и биологических сетей различной природы, а также моделирование циркадного осциллятора в печени мыши и его взаимодействия с биологическими процессами, включая:

- выявление биологических процессов, имеющих ритмичные изменения активности на основе анализа данных суточной экспрессии генов, генных сетей и сетей белок-белковых взаимодействий;

- моделирование взаимодействия циркадного осциллятора с функциональной системой NAMPT/NAD+/Sirt1 и предсказание возрастных изменений в экспрессии генов циркадного осциллятора;

- моделирование взаимодействия между циркадными часами и реакцией воспаления в клетке млекопитающих.