Для развития биоинформатики в СО РАН создадут специализированную распределенную вычислительную систему
Президиум Сибирского отделения РАН принял решение о создании на базе консорциума научных и образовательных организаций Новосибирского научного центра распределенной высокопроизводительной вычислительной системы для анализа больших данных в области наук о жизни. Предложение по подготовке вычислительной системы поручено подготовить научному руководителю ИЦиГ СО РАН академику РАН Николаю Александровичу Колчанову и директору Института вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, доктору физико-математических наук Михаилу Александровичу Марченко.
Заслушав и обсудив на заседании президиума СО РАН сообщения академика РАН Николая Александровича Колчанова «Большие генетические данные, биоинформатика и системная компьютерная биология» и «О Научном совете по биоинформатике СО РАН», президиум федерального государственного бюджетного учреждения «Сибирское отделение Российской академии наук» одобрил работу Научного совета по биоинформатике СО РАН за последние шесть лет.
Утвержден новый состав Научного совета и Бюро Научного Совета по биоинформатике СО РАН. В новый состав Бюро вошли 16 сотрудников и руководителей организаций Новосибирского центра, в том числе академики Николай Александрович Колчанов (ИЦиГ СО РАН), Виктор Валентинович Альт (СибФТИ СФНЦА РАН), Любомир Иванович Афтанас (Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины), Сергей Савостьянович Гончаров (Институт математики им. С. Л. Соболева СО РАН), Ольга Ивановна Лаврик (ИХБФМ СО РАН), Андрей Юрьевич Пальянов (Институт систем информатики им. А.П. Ершова СО РАН), а также д.ф.-м.н. директор ИВМиМГ СО РАН Михаил Александрович Марченко.
В состав Научного Совета вошли представители ЦКП «СКИФ», ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора, Красноярского научного центра СО РАН, Томского научного центра СО РАН, ведущих университетов Сибирского федерального округа. В состав Совета также включен Чен Минг (Chen Ming), профессор, руководитель группы по биоинформатике, отделение биоинформатики Чжэцзянского Университета (г. Ханчжоу, Китай).
«Развитие наук о жизни сегодня невозможно без разработки нового поколения эффективных методов компьютерного анализа больших данных и математического моделирования биологических систем и процессов, - отметил д.ф.-м.н. директор ИВМиМГ СО РАН Михаил Александрович Марченко. – В качестве примера можно привести преодолений последствий нового вызова, с которым столкнулось человечество - распространение коронавируса SARS-CoV-2. Сложившаяся ситуация заставила по- новому взглянуть на понимание и практическое применение огромных объемов генетической информации исключительно высокой сложности на различных иерархических уровнях организации живых систем: начиная с геномов, генов, белков, метаболических путей и генных сетей, включая клетки и ткани и заканчивая целостными организмами, популяциями и экосистемами. В связи с этим необходима существенная интенсификация развития новых методов искусственного интеллекта и машинного обучения в области биоинформатики и системной компьютерной биологии, ориентированных как на решение фундаментальных задач генетики, так и на различные области её применения в биомедицине, фармакологии, биотехнологии, сельском хозяйстве и других сферах. Это ставит целый ряд задач, проведение большой организационной и образовательной работы. В настоящий момент математические институты Новосибирского научного центра обладают достаточными компетенциям для организации распределенной высокопроизводительной вычислительной системы для анализа больших данных в области наук о жизни, а участие в этой деятельности представителей научных организаций различного профиля и направлений исследований позволит обеспечить лучшие возможности для междисциплинарного взаимодействия и достижения поставленной цели.
Для решения задач обработки больших биологических данных и создания высокопроизводительной вычислительной системы было предложено создать консорциум научных и образовательных организаций Новосибирского научного центра. Консорциум объединит в единую систему вычислительное оборудование организаций, их системы хранения данных, программное обеспечение. Также для реализации общих целей будут объединены коллективы специалистов с их уникальными компетенциями и опытом. Создаваемая система предполагается открытой и расширяемой за счет ресурсов новых участников консорциума».